En 199x, la folie des hommes provoqua une guerre mondiale nucléaire qui dévasta la surface du globe. Toute forme de vie est effacée de la surface de la terre. Les mers sont asséchées, et les terres crevassées pour plus ne formées qu’un vaste désert stérile. Le désert recouvre une grande partie du monde, l'eau est devenue rare et enjeu de batailles. L'anarchie règne.
Pourtant la race humaine n’a pas totalement disparu. Les rares survivants sont organisés en bandes, et luttent pour leur survie. L’eau et la nourriture sont devenu les seules richesses. Une nouvelle ère de violence est en marche.
Dans ce monde erre, solitaire, Kenshirô. Il est l'héritier du Hokuto Shinken, un kung-fu d'assassins transmis de génération en génération depuis plusieurs milliers d'années.
Cependant Ken utilise cet art pour défendre les innocents face aux hordes de bandits...